Man wird zumindest schriftlich darauf hingewiesen, also würde ich es einfach vermeiden. Inwieweit es da Schnittstellen gibt ist mir nicht bekannt.
Etwas irritierend finde ich, dass unser Finanzamt immer 2 oder 3 Jahre gewährt für die Bescheinigungen. Das aber im Wechsel teilweise, erscheint mir etwas willkürlich.